Το βουνό του Αγίου Γεωργίου υπήρξε χώρος λατρείας ήδη από την αρχαιότητα. Η ανασκαφική έρευνα από το 1992 έως το 1994 αποκάλυψε το "Μινωικό Ιερό της Κορυφής", εύρημα ιδιαίτερα σημαντικό για την μελέτη της μινωικής θρησκείας, αφού το ιερό αποτελεί το μοναδικό μνημείο του είδους που βρέθηκε ασύλλητο. Στον χώρο βρέθηκε πλήθος από λίθινα λατρευτικά αντικείμενα (ένα έχει γραμμική γραφή Α’), πήλινα ειδώλια ζωών, χάλκινα ανθρώπινα είδωλα λατρευτών, χάλκινα αφιερώματα, κοσμήματα, κεραμικά. 

Το εκκλησάκι του Αγ. Ιωάννου του «εν Κρημνώ» ή «εν Γκρεμνόν» βρίσκεται σκαρφαλωμένο πάνω σε βράχο - όπως δηλώνει άλλωστε και το όνομά του - και μέσα σε μια σπηλιά, σε υψόμετρο 100 περίπου μέτρων πάνω από το Καψάλι. Για να φτάσετε εκεί θα χρειαστεί να ανεβείτε 130 πέτρινα σκαλοπάτια, όμως η θέα προς το λιμάνι που θα αντικρίσετε από ψηλά θα σας ανταμείψει για τον κόπο σας. Το εκκλησάκι σήμερα τιμάται στον Αγ. Ιωάννη τον Πρόδρομο και ανακαινίστηκε το 1725 από τον μοναχό Ιωαννίκιο, όπως μαρτυρά η επιγραφή της εισόδου.

Το σπήλαιο της Αγίας Σοφίας. βρίσκεται σε μια απόκρημνη περιοχή, εξαιρετικού κάλλους, στη δυτική πλευρά των Κυθήρων, 60 περίπου μέτρα πάνω από την θάλασσα. Σύμφωνα με την παράδοση, υπήρξε ιερό των νυμφών και μετέπειτα λατρευτικός χώρος στα χριστιανικά χρόνια. Η εξερεύνηση και λεπτομερής χαρτογράφηση του σπηλαίου έγινε με δαπάνες της σπηλαιολόγου Άννας Πετροχείλου το 1955. Οι εξαίρετες αγιογραφίες ενός κτιστού τέμπλου που βρίσκεται στον προθάλαμο χρονολογούνται από τον 13ο αιώνα.